开发的小程序可以对应不同的银行吗？

开发了一个小程序，公司下面有好几个子公司，每个子公司都是不同的银行，现在小程序入账只有一家公司，但马上别的公司业务也要接进来，是不是这家公司也只能是同一个银行，同一家银行可以不同的商户号这个我知道的，但是不同的银行是不是就不行？